2020年1月14日，复旦大学与上海申康医院发展中心签署协议，双方合作共建上海市质子重离子医院（上海市质子重离子临床技术研发中心），上海市质子重离子医院挂牌成为复旦大学附属医院。

复旦大学常务副校长、上海医学院院长桂永浩与上海申康医院发展中心主任、党委书记王兴鹏代表双方签订《合作共建上海市质子重离子医院协议书》，并与上海市质子重离子医院陈建平董事长共同为“复旦大学附属质子重离子医院”揭牌。

上海市质子重离子医院自筹备之始即与复旦大学附属肿瘤医院深入融合，两院在诊疗资源、人才团队等方面高度共享，互相促进。本次合作共建签约，两院的高度融合与合作在原有基础上更加拓展、深入。同时，复旦大学附属质子重离子医院的“诞生”，是服务“健康中国2030”国家战略、服务长三角一体化发展国家战略、服务上海建设亚洲医学中心城市战略的具体体现，也是服务社会、服务人民群众就医需求的一项实际举措。

复旦大学在医、教、研各方面的强有力支持，作为尖端肿瘤放疗技术先行先试的排头兵、领跑者，上海市质子重离子医院将继续围绕肿瘤疾病诊治、科学研究等方面下“硬功夫”，不断创造质子重离子治疗“上海标准”“上海经验”，打造国际一流的质子重离子治疗和研发中心。同时，上海市质子重离子临床技术研发中心将在复旦大学临床研究和核物理等尖端优势的基础上，进一步增强创新技术研发和产业转化。

作为目前全球范围内唯一通过“国际医疗机构评审联合委员会”（JCI）认证的质子重离子中心，在上海申康医院发展中心和复旦大学的大力支持下，上海市质子重离子医院自开业以来已实现快速发展，并正全面朝高质量、可持续发展方向转变。医院运营四年半以来已累计完成治疗患者2500余例，其中，2019年治疗患者出院数创新高，已大大超过800例以上，步入国际一流粒子机构领先水平。医院以患者需求为导向，突出重离子技术优势，鼻咽癌、颅内颅底肿瘤、早期肺癌、肝癌、前列腺癌、胰腺癌等6个重点病种治疗患者数占治疗总数的60%以上。重离子治疗复发鼻咽癌、肺小结节肺癌等实现了国际放疗领域“零的突破”。医院海内外知名度和认可度不断提升，来自长三角地区的患者约占全部患者数的60%，另有40余名外籍及港澳台地区患者慕名来院接受治疗并出院。“上海重离子”医疗服务品牌在国内乃至世界的影响力持续提升。