近期，国际顶级期刊Nature旗下《Communications Biology》在线发表了我校食品科学与工程学院骆驼团队的明亮、伊丽等为并列第一作者的最新研究成果，研究成果从基因组层面揭示了双峰驼遗传多样性和起源进化史。中国科学院上海生命科学研究院李亦学研究员、我校食品科学与工程学院吉日木图教授等为通讯作者。
　　近年来，项目组对东起蒙古高原，西至里海地区典型的家养双峰驼栖息地的各种品系进行了采样，收集了蒙古戈壁阿勒泰地区濒临灭绝的野生双峰驼样本，以及伊朗地区的家养单峰驼样本。项目组共收集到了128份不同群体的骆驼样本，构建了目前最全面的骆驼样本库。为进一步揭示不同骆驼群体间的基因交流历史，项目组又对这些样本展开了全基因组测序，从遗传学角度揭示双峰驼的迁徙路线。
　　该研究发现，单峰驼群体的基因组遗传多样性最高，野生双峰驼群体基因组遗传多样性最小，这可能与现存野生双峰驼栖息地不断缩小、种群数量急剧减少有关。通过计算两两群体之间Fst值发现，单峰驼与家养双峰驼群体之间存在最高的遗传距离，不同地域之间的家养双峰驼之间存在较小的遗传分化；然而有趣的是，在家养双峰驼群体间，伊朗双峰驼与其他双峰驼群体存在最高的遗传距离。MDS、Admixture和TreeMix的结果表明单峰驼和中亚的家养双峰驼群体（哈萨克斯坦、俄罗斯和伊朗地区）之间存在基因交流事件，该基因交流事件也被F3/F4统计支持。
　　为了排除基因交流所带来的影响，研究者通过“BABA/ABBA”统计学方法从双峰驼基因组中去除单峰驼基因组渗入的部分，进一步通过Admixture计算了两两群体之间Fst发现，在所有的家养双峰驼群体中，伊朗双峰驼群体仍显示出了最高的遗传分化（0.04-0.06）。为了证实此结论，研究者采用线粒体全基因组序列构建了最大似然树，来自伊朗地区的两个mtDNA序列形成了最基础的分支。再一次支持了家养双峰驼中亚起源的事件。
　　另外，通过G-PhoCS对单峰驼和双峰驼群体进行了群体历史分析，发现家养双峰驼和野生双峰驼分离时间发生在43万年前（95%，置信区间：13-73万年），晚于线粒体基因组研究的结果；在家养双峰驼群体中，大约在4450年前（95%，置信区间：70-17600年）伊朗双峰驼最先分离出来，说明伊朗是家养双峰驼的驯化之地，而后大约2400年前（95%，置信区间：10-78400年），双峰驼向东路线到达蒙古高原，形成了表型特征各异的不同品种或类型。

在线文献
https://www.nature.com/search?q=Whole-genome%20sequencing%20of%20128%20camels%20across%20Asia%20reveals%20origin%20and%20migration%20of%20domestic%20Bactrian%20camels&order=relevance

参考文献

Liang Ming, Liyun Yuan, Yi Li, et al. Whole-genome sequencing of 128 camels across Asia reveals origin and migration of domestic Bactrian camels, Communications Biology, 2020. https://doi.org/10.1038/s42003-019-0743-6